رییس جمهوری ایران در واکنش به قطع مناسبات دیپلماتیک عربستان با حکومت اسلامی ایران گفت که این اقدام ریاض نمی تواند بر اعدام شیخ نمر، روحانی شیعه سعودی سرپوش، بگذارد. رییس جمهوری ایران در جای دیگری از سخنانش افزود که اعدام و سربریدن پاسخ انتقاد نیست. او ابراز امیدواری کرد که کشورهای اروپایی نسبت به آنچه وی نقض آشکار حقوق بشر توسط دولت عربستان نامید از خود واکنش در خور نشان بدهند.
در اظهاراتی جداگانه، محمدباقر نوبخت، سخنگوی دولت حسن روحانی حمله به سفارتخانه و کنسولگری عربستان را در ایران که به بروز بحران در مناسبات ریاض و تهران منجر شد، اقدامی “نکوهش بار و مشکوک” توصیف کرد که به گفتۀ او “از نظر شرعی و قانونی غیرقابل توجیه است.” وی همچنین گفت که “دستگاه قضایی ایران با قدرت در حال پی گیری موضوع است و با حمله کنندگان و متخلفان برخورد خواهد کرد.”
اگر چه رییس جمهوری ایران با اشاره به کشته شدن شیخ نمر گفت که “اعدام پاسخ انتقاد نیست”، اما، جمهوری اسلامی ایران به نسبت جمعیت دارای بیشترین شمار اعدام ها در جهان است و هزاران تن از منتقدان و دگراندیشان سیاسی و مذهبی در زندان های این کشور به سر می برند و محاکمات آنان سی و هفت سال پس از انقلاب اسلامی همچنان توسط دادگاه های انقلاب پشت درهای بسته و بدون رعایت ابتدایی ترین حقوق زندانی صورت می پذیرد.