Reza Amiriسرکوب و نقض حقوق اقلیت‌های مذهبی مانند بهاییان و اقلیت‌های قومی و جنسی، از دیگر موارد اعتراض نمایندگان پارلمان اروپا به آقای ظریف بود.
وبسایت رسمی پارلمان اروپا خبر داد که نمایندگان پارلمان اروپا به وزیر امور خارجه ایران متذکر شدند که این موارد می‌تواند بر «روابط آینده» با جمهوری اسلامی تاثیر منفی بگذارد.
بر اساس این گزارش، محمدجواد ظریف در پاسخ به انتقادها تایید کرده که وضعیت حقوق بشر در ایران «نیاز به بهبود» دارد و آمادگی ایران را برای گفت‌وگو با اتحادیه اروپا بر سر این موضوع بر مبنای «احترام متقابل» اعلام کرده است.
اما خبرگزاری دانشجویان ایران (ایسنا)، بخش‌های بیشتری از سخنان آقای ظریف را منتشر کرده که در آن از جمله، به «نقض سیستماتیک حقوق بشر و تبعیض نژادی و مذهبی و قومی» در اروپا اعتراض شده است.
او همچنین خواستار توجه نمایندگان پارلمان اروپا به «واقعیت‌های موجود ایران و از جمله حاکم بودن صندوق‌های رای در تعیین دولت‌ها» شده است.
سازمان‌های بین‌المللی، دولت‌ها، نهادها و شخصیت‌های متعددی، همواره به نقض گسترده حقوق بشر در ایران از جمله میزان بالای اعدامها، ردصلاحیت نامزدهای انتخابات، رعایت نکردن حقوق اقلیت های دینی و مذهبی و سانسور انتقاد کرده‌اند.
جمهوری اسلامی هرگز این انتقادات را نپذیرفته است.
